（一）人类健康面临多方面的威胁 进入20世纪80-90年代，传染病危害仍然是危害人类健康的严重疾病。而全球化趋势、自然生态系统的破坏、滥用抗生素等又使预防和控制这些传染病具有相当的复杂性。2000年心理或精神疾患占全球疾病负担的12%。而且这一疾患正在威胁着越来越多的青少年。
（二）全球化对公共卫生领域的挑战 全球化是指国家间物品、服务、资金、人、理念及信息的跨界流动及其在全球水平的互相作用，它由3个相互联系的层面组成：经济开发、跨界流动及管理跨界流动的组织和规则。国际贸易可通过一个复杂的过程对公共卫生产生重要影响。
（三）把伤害纳入疾病控制刻不容缓 一个重要但是长期被忽视的公共卫生问题是全世界每年有700万人死于伤害和暴力。伤害并非“意外”，是和疾病一样可以被认识、预测和控制。伤害是有因可究、有源可寻、可以预防和能够控制的。
（四）食品安全不容忽视 近年来，国际上食品安全恶性事件不断发生。随着全球经济的一体化，世界各国间的贸易往来会日益增加，食品安全已变得没有国界，世界某一地区的食品安全问题很可能会波及全球。
（五）生物恐怖及其应对 生物恐怖袭击影响面积大，制剂具有传染性，危害时间长，生产容易，成本低廉；难以防护、便于进行突然袭击等特点。
（六）突发公共卫生事件及其应对 据我国现阶段的国情，制定了《突发公共卫生事件应急条例》，就如何提高应对能力，建立突发公共卫生事件应急处理机制，建立有效的预警系统，有效应对新的传染病的出现，防止事件的传播，提供了相应的策略和措施。
（七）新世纪青春期卫生面临的挑战 青少年除了经历在身体发育方面的突飞猛进和一系列复杂的生长发育过程外，同时还伴有社会心理发展。
（八）老龄化 老龄化是关系国计民生和国家长治久安的重大战略性社会问题，必须从改革、发展、稳定的大局出发，总揽全局，提出相应的对策，作出战略性选择。
（九）艾滋病和结核病 艾滋病在2005年9月底，全国累计报告HIV感染者135630例，其中艾滋病患者31143例，累计死亡7773例。结核病一直是危害人类健康的公共卫生问题和社会问题。WHO报告，我国属于全球22个结核病高负担国家之一，结核病人数位于世界第2位。
