主要为一过性的恶心和呕吐，身体出现特殊气味、恶心和胃炎不常发生，由于引起这些反应的病理复杂，很难估测这些反应得发生率。口服或静脉注射左卡尼汀引起癫痫发作，不论先前是否有癫痫病史，先前有癫痫发作的患者，可诱发癫痫或使癫痫加重。在一项慢性血透患者双盲、安慰剂对照试验中，出现的不良反应(不考虑因果关系，仅报道发生率≥5%的反应)主要有:
1 全身系统:胸痛、感冒症状、头痛、注射部位反应、疼痛等。
2 心血管系统:心血管异常、高血压、低血压、心动过速等。
3 消化系统:腹泻、消化不良、恶心、呕吐等。
4 内分泌系统:甲状腺异常等。
5 血液淋巴系统:贫血等。
6 代谢系统:高钙血症、高钾血症、血容量增多症等。
7 神经系统:头晕、失眠、压抑等。
8 呼吸系统:咳嗽、咽喉炎、鼻炎等。
9 皮肤:瘙痒、皮症。
10 泌尿系统:肾功能异常等。
