一、一、功能医学是治疗病因的医学。
功能医学是从遗传环境心理生活方式和生理的联动关系入手，通过研究人体由生理功能下降到病理改变的发病过程，来判断功能变化程度、疾病的发展进程，找出功能下降及及及疾病产生的原因，做到早期发现疾病及预防未来疾病的发生。在此基础上给出具有针对性的个性化干预方案。
功能医学是以系统循证医学为基础。通过先期评估早期预防以及改善机体功能的方法来全面干预和治疗慢性疾病的新型医疗模式。它专注于针对个性化病因，而不是简单的症状治疗。
二、
功能医学主要通过纠正病人的生理生化功能障碍。恢复功能平衡来改善病人的健康，防止疾病的发生和发展。设法重建机体内在的平衡以达到最佳的健康状态是功能医学努力的目标。
功能医学理论认为人体器官功能的长期减退是导致人类患上慢性疾病的罪魁祸首，任何慢性疾病发生前都有长期功能下降的过程。科学研究证明，如果机体中受损的生理机制，不能得到及时的纠正，那么我们就会主观感觉到身体不适，如果这种异常状态持续时间过久，那么功能平衡就会逐渐演变成临床显性的症状和体征。具体从代偿期进入失代偿期，此后机体会有疾病前的状态迅速进入到疾病的状态。同样要是我们掌握了机体功能平衡理论，及时调整机体中各个组织器官系统出现的功能失衡状况恢复机体生理过程的有效运转，我们就会一直保持健康状态。
病人周遭的环境因素以及病人自身的生理活动都会对慢性疾病的治疗进程产生影响。所以治疗疾病，改善健康，我们要做的就不仅仅是“对症下药，循症医病”。在功能医学中，我们将会运用多层次的干预机制来完善现今临床医学的不足之处，从而最大限度的改善和恢复病人的健康状态以及功能活动。
三、功能医学是“上游医学”。它是一个回溯的过程，以“追根究底”为特征，我们会追溯患者的病史、生活史、追溯疾病的起源，回到机体开始出现紊乱的那一刻，因此说功能医学是寻找病因的医学。
四、功能医学更是治未病医学。我们通过维持机体基本生理过程来保障器官组织的功能失衡。功能医学坚持的是重塑机体健康和功能的治疗方法，而不是简简单单控制疾病的症状和表现。
五、功能医学是将生物化学、生理学、免疫学、营养学、遗传学等多学科综合，把生物医学研究中的科学证据加以整合并运用。功能医学完全是基于科学的原则和数据，但也采用医学上灵活、折中的方面。饮食干预、临床营养、运动治疗、身心与精神问题、植物医学、物理医学等，只要是在有科学依据的前提下都可以整合到功能医学的教学与实践。功能医学主张，在合适的情况下生活方式的干预是占首位的。因为这不仅成本花费低，更重要的是，在健康的恢复、疾病的治疗和预防疾病并发症中有长期显著的影响。
六、功能医学的理论发展和最新发表的各种科学文献关系密切其力求时刻与人类生理生化领域的新发现接轨，使我们能够更深刻地理解人体基本的生理生化过程。只有深入了解人体复杂的高级功能活动，我们才能将这些功能活动进一步优化并增强体质；只有理解了临床失衡的本质才能提高治疗复杂慢性病的能力。功能医学不断的将这些最新的科学文献中所展示的研究成果整合到功能医学的临床治疗干预模式中。功能医学不是通过消除症状来治愈疾病，而是通过纠正引起功能紊乱和疾病产生的病因来修复机体，恢复健康。
